Hola Francis. Es una pregunta muy interesante que a veces no se explica hasta la universidad. No hay que olvidar que en el fondo los alelos son versiones distintas de un mismo gen, y por tanto versiones distintas de una proteína*, y muchas veces lo que cambia de uno a otro es la cantidad de proteína que se produce o su nivel de actividad (lo bien que hace su trabajo). Normalmente las células utilizan sus dos alelos a la vez como fuente de proteínas y en muchos casos un alelo puede compensar los problemas de otro. Si por ejemplo un gen codifica una proteína de color rojo, a lo mejor un alelo es funcional y realmente produce esa proteína, pero otro alelo está mutado y no la produce o produce muy poca. Cuando tienes dos alelos que la producen, obviamente te sale color rojo. Con un alelo que la produce y otro que no, el que la produce puede compensar y habrá color rojo. Pero si ningún alelo la produce, no habrá proteína de color rojo. Y el color que veremos será por ejemplo blanco. Diremos que el rojo es dominante sobre el blanco, y que el blanco es recesivo respecto al rojo. Es interesante que a lo mejor no es realmente que uno haga una proteína roja y otro la haga blanca, sino que uno haga rojo y otro no haga nada. Y ese caso es muy común para los alelos. Aunque en el fenotipo vemos "efecto X" o "efecto Y", a nivel molecular lo que suele haber es solo "nivel normal" de efecto X, "exceso" de efecto X (si la proteína se hace en mayor cantidad, o es más activa, o incluso no puede ser desactivada), "carencia" o incluso "ausencia" de efecto X (si la proteína no puede llegar al lugar donde debe hacer su trabajo o si no se produce suficiente, o si está siempre desactivada, o si es destruída o destruye otra proteína importante)... Y dependiendo de si la célula puede compensar el exceso/carencia o no, el alelo será recesivo (si una versión normal lo compensa) o dominante (si una versión normal no es suficiente para compensar). Aunque recuerda siempre que la dominancia es un fenómeno estrictamente relativo a la relación entre dos alelos de un gen. Si diferenciamos gen y alelo, lo que puede ser dominante, recesivo etc es un alelo. No el gen. Y no lo es por sí mismo, de forma inherente. Un mismo alelo puede ser dominante respecto a otro, recesivo respecto a un segundo y codominante con un tercero. *(o ARN en el caso de algunos genes que no llegan a hacer proteínas, o grupo de proteínas/ARNs si el gen tiene posibilidades de splicing alternativo o varios marcos abiertos de lectura). Te felicito por cuestionarte el por qué las cosas son como son. Eso te ayudará a comprender mejor lo que estudias. Si te queda alguna duda puedes volver a preguntar ;)